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CircRNA profiles analysis of neuroblastoma for identification of drug targets

2025年 2月

魏彦杰团队在IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics期刊上发表了题为“CircRNA profiles analysis of neuroblastoma for identification of drug targets”的文章，通过分析神经母细胞瘤数据发现三个环状RNA可以作为疾病诊断的生物标记物，其蛋白产物可以作为潜在的药物靶点。

神经母细胞瘤是一种常见的儿科恶性肿瘤，高危患者的 5 年生存率较低。尽管现有治疗手段不断优化，但预后仍然不佳。因此，寻找新的有效治疗靶点对于改善患者预后至关重要。魏彦杰团队对两组神经母细胞瘤组织的环状 RNA（circRNA）测序数据进行了综合分析，以筛选潜在的药物靶点。通过比较神经母细胞瘤组织与邻近正常组织的 circRNA 表达水平，鉴定出一批差异表达的 circRNA，并利用加权基因共表达网络分析预测了 30 个与疾病相关的 circRNA。为了进一步探讨这些 circRNA 的功能作用，分析了其与 RNA 结合蛋白（RBP）的相互作用。结果表明，hsa_circ_0051680 可能通过与 FUS 结合影响神经母细胞瘤的进展，而 hsa_circ_0006107 可能通过调控 IGF2BP1 发挥作用。此外，研究团队评估了关键 circRNA 的翻译潜能，发现其中 6 种 circRNA 可编码蛋白，这些蛋白具有复杂的二级结构。进一步的分子对接分析表明，circRNA 编码的蛋白（hsa_circ_0000786、hsa_circ_0005087、hsa_circ_0006867）可与其相应配体形成 5 个高亲和力复合物。这些 circRNA编码蛋白的发现，为神经母细胞瘤的诊断和治疗提供了新的潜在药物靶点，有望推动该疾病的精准医学研究和个性化治疗策略的开发。